離島設置快篩站，每日自願快篩的比例雖然逐漸成長，但離島的澎湖縣、金門縣卻還是認為這樣的篩檢成效不如預期。金門縣和澎湖縣如今就向中央來喊話，希望進行入境強制篩檢。

澎湖機場工作人員說：「要做快篩嗎來這邊。」工作人員手舉牌子，搭飛機來到澎湖的旅客可以自願快篩，只是一般民眾意願普遍不高，澎湖縣政府發言人陳其育說：「民眾沒有快篩就入境澎湖，他們可能會形成防疫的破口，我們向中央要求，所有入境澎湖的旅客一律要在機場快篩。」29日澎湖只有175人自願篩檢，其中1人陽性好在PCR檢驗陰性，但未篩檢的民眾有沒有染疫？卻無從掌握。

澎湖縣政府發言人陳其育說：「決定從六月一號開始，所有入境澎湖的旅客都一律必須快篩，那拒絕快篩的民眾，我們會強制要集中檢疫十四天。」要求離島強制快篩，金門縣也有致一同，金門縣長楊鎮浯說：「往離島的機場，也就是松山、台中、高雄等，三個由台灣飛往金門的機場，能夠實施強制快篩。」就怕確診者一旦入境，離島醫療將快速癱瘓，金門澎湖同聲喊話中央，就是不願讓病毒有機可乘。