國際間的武漢肺炎疫情持續擴大，台灣也出現零星社區感染個案，中央疫情指揮中心，也提升到一級開設，由衛福部長陳時中續任指揮官，可以跨部會運用資源來防疫，客運業也立刻因應，從今(28日)開始，乘客一律要量體溫、戴口罩，只要額溫超過37.5度，就不能上車，讓乘客全額退票。 大動作宣示提升防疫等級，同樣擔任指揮官的陳時中，將可以更有效的整合各部會資源，全力投入防疫工作，接下來各部會出席會議的層級，都提高到副首長以上。行政院長蘇貞昌：「從發生的確診案例來看，已經有社區感染，雖然他是零星個案，我們要料敵從寬、禦敵從嚴。」 台北市隨後也宣布跟進中央。台北市長柯文哲：「中央要一級開設，台北市還是會配合辦理。」至於新北市和高雄市，則是在過年期間就將防疫提升到最高等級，同一時間客運業者立刻動起來，在轉運站設下防疫關卡。 從228連假開始，沒有戴口罩一律禁止搭乘客運，體溫過高也不能上車，受到疫情影響，228連假客運人潮也瞬間減少，國光首都和大都會客運，業績掉了三成，和欣客運也少了一成五，但是防疫優先，所有的不方便，只為了讓民眾更安全。