凌晨3時57分發生規模6.4強震，台南傳出大樓倒塌，總統馬英九清晨6點抵達中央災害應變中心，了解災情，隨後搭乘專機南下勘災。 馬總統專機預計在9點半抵達台南，馬英九表示，一早已經和台南市長賴清德通過電話，指示各單位全力搶救，並且有足夠救助人力，現在全台國軍總動員，交通方面，台鐵沒中斷，高鐵會在停止後檢查，也會在最短時間通車。