葉菊蘭所領導的高雄捷運調查小組，談到勿枉勿縱，調查行政院長謝長廷，一樣秉持公平原則，在立院卻引發國親立委的強烈質疑，他們說葉菊蘭敢不敢調查自己的頂頭上司謝長廷是認為很可疑的，認為行政調查不該超越司法調查，而行政院長謝長廷則是發表示調查的話就要公平，調查就要查每個高雄市長。 　　高捷案怎麼查，陳水扁總統一句話點名葉菊蘭成立調查小組，只是自己人查自己人，在野立委很不服。在野立委質疑行政調查根本就要超越司法調查，法務部說其實根本不衝突。 　　 　　法務部要徹查到底，歷任高雄市長當然無一倖免，立院國是論壇不分朝野都要問行政院長謝長廷，高捷案怎麼收尾。高捷弊案滾雪球越滾越大，不論涉案層級，都逃不過行政司法雙重檢驗。