對抗禽流感，衛生署已經展開全面備戰，首先是抗病毒藥物克流感，目前的安全存量根本不夠，疾管局將直接購買克流感的原料，訓練本國藥師，自行調配，另外全台灣七百六十五間負壓隔離病房，也將全面啟用。 　　一個又一個口罩不停送出，這家位在彰化田中的口罩製造工廠，四條生產線，二十四小時沒有停過，就算一天製造十萬個，訂單還是消化不完，不過業者隨時可以增加兩條生產線，在口罩防護衣這類物資方面，不只業者樂觀，疾管局也表示，現在儲存量，就算禽流感疫情爆發，也能供應兩百天。 　　而最有效的防治藥物克流感，也將在明年九月，購足九十二萬人次，也就是總人口百分之四的使用量，不過這離百分之十還有段距離，因此已經打算進口克流感原料，訓練一百家醫院藥師，調配克流感藥水，只要等待藥廠開放專利，衛生署保證我國有自行生產克流感的能力，而就算最糟情況，疫情一旦擴散，全台二十三家醫院的超過七百六十五床的負壓隔離病房將全面啟動。 　　而各縣市也開始尋找大型收治場所，花蓮不排除臨時徵召育田醫院的精神病房，台北不排除挪用小巨蛋，對抗禽流感，全台上緊發條。