針對日本交流協會官員向台灣高層表達應慎重處理公民投票一事，台北駐日經濟文化代表處今天也向日本媒體發表嚴正立場。代表處指出，防禦性公投既非尋求台灣獨立，也不是試圖改變
台海兩岸現狀，而是基於保障台灣安全的考量，要求中國全面撤除對台部署飛彈以及宣示放棄武力犯台。
在日本前首相森喜朗訪問台灣並且和陳水扁總統晤談之後，財團法人日本交流協會台北事務所長內田勝久，隨即要求與中華民國總統府秘書長邱義仁會面，藉機轉達日本政府希望台灣慎重處理公投的立場。
為了正確表達台灣官方的理念，台北駐日代表處特別在今天致函日本媒體，表明台灣預備實施公投的真正意圖，主要是為了有效維護台灣的安全保障。