台北市長馬英九今晚批准市府衛生局長邱淑媞辭職，馬英九表示，他批准邱淑媞辭職，除因疫情發展已接近尾聲，也希望讓邱淑媞脫離媒體焦點，讓防疫工作受到更多關注。邱淑媞則表示，她將改當喜鵲，預期疫情將轉趨樂觀。

馬英九說，邱淑媞中午自宜蘭返回台北後，第三度向他強烈表達請辭意願。到了晚間，他與邱淑媞長談，最後決定讓邱淑媞離開崗位。馬英九也推崇邱淑媞在一年十個月局長任內，對台北市公共衛生所作出貢獻。

暫代衛生局長職務的副市長歐晉德則對未來工作重點表示，他上任後將全力整合市府各單位資源，全力作好醫院及社區的防疫工作。至於專業的醫療事宜，就由專業來執行。

歐晉德還說，何時能恢復正常，他不敢說，但要早日恢復正常，除了醫護人員的努力，更需要民眾一同努力。