為對抗SARS疫情，澎湖展開全縣大規模消毒工作，馬公市公所完成朝陽里、陽明里、興仁里、烏崁里、桶盤里及舊仁愛之家、勞工育樂中心周遭環境進度後，第一階段消毒工作完工正式告一段落。

為了防止SARS疫情擴散，縣府除推動今年母親節為防疫大掃除日外，縣長賴峰偉同時要求環保局，分發消毒藥水，加強各村里社區清潔及清毒工作，協調各鄉市公所排定計畫時程，於每一村里進行地毯式消毒，湖西、白沙、西嶼、望安、七美等五鄉，陸續在五月十二日完成全鄉消毒作業。