受到嚴重急性呼吸道症候群ＳＡＲＳ病例在兩岸擴散影響，金門縣金城鎮南門天后宮管理委員會決定取消四月間的大陸湄洲、泉州媽祖廟進香活動，以免疫情跟著交流。
南門天后宮管理委員會為慶祝媽祖聖誕，原本準備在四月十一日組成一百五十人的進香團，循小三通管道前往福建湄洲祖廟、泉州天后宮進香。南門天后宮管理委員會表示，由於發生ＳＡＲＳ疫情，雖然大陸福建省還未被波及，但是為防萬一，組團進香的計劃決定取消。