面對許多國家陸續發生重症急性呼吸道症候群，交通部已配合啟動緊急應變小組機制，通令所屬民航局、各港務局相關單位採取因應措施，加強國際機場及商港防範疫情蔓延。
交通部表示，已請各航空公司針對搭載來自大陸、香港、越南及新加坡等地旅客回台灣的班機，加強向旅客宣導有關防疫措施，如旅客有身體不適狀況，建議旅客在入境時填寫相關症狀申報單。
同時請各航空公司在客機上配置適當數量口罩，如在客艙中發現有疑似症狀的旅客，立即採取必要的隔離措施，由機長通知擬著陸國家，並依當地衛生檢疫單位規定進行消毒。