中央研究院院長李遠哲是否擔任陳水扁總統競選下一任總統的副手人選，成為立法院資訊委員會的攻防議題，李遠哲強調，陳水扁或其他人士均未曾徵詢過他的意見，而且這些事情和他的人生規劃不同，他只想為中研院的研究工作以及提昇台灣產業技術而努力。李遠哲鄭重表示，他不會考慮去擔任競選總統副手的問題，因為人各有志，這和他的人生規劃不同。