目前飛安會已經組成調查小組，飛安官也搭乘一早七點班機飛往馬公。飛安會表示，失事前班機機長曾經要求調降高度，是不是當時已經發生什麼狀況，飛安會將進行深入調查。

　　復興航空飛往澳門的貨機，是在二時零七分在雷達螢幕上消失，根據航管紀錄失事前飛機已在一萬八千呎巡航高度，駕駛曾要求將高度降到一萬六千呎，一般來說，除非是飛機本身有緊急狀況或是天氣突然有大變化，飛機在達到巡航高度後不會降低飛行高度，飛安會對於機長的要求也覺得有異，目前已經調出當時的天候狀況進行調查。