在美國遭受恐怖攻擊後不到半天，阿富汗首都喀布爾也傳出爆炸案，當地時間凌晨兩點半，整個市區傳出了陣陣的爆炸聲，還有戰機和防空砲火劃過夜空的聲音，在北部機場附近，傳出砰然巨響，並且立即出現火光，根據研判可能是受到飛彈攻擊。各界對這聲爆炸有不少揣測，甚至有人懷疑這是美國以強硬手段，報復阿富汗包庇恐怖份子的行動，因為美國追緝的頭號恐怖份子賓拉登，一直住在阿富汗境內，但是美國否認對阿富汗發動任何攻擊。