釋憲結果，行政院以及總統府的態度，也備受矚目。行政院表示，對於大法官會議結果欣然接受，並強調：將選擇在適當時機，向立法院提出停建核四的報告；行院院同時認為，依照大法官解釋的精神，在進行相關停建報告之前，核四廠應該仍處於停建狀態。

　　除了對大法官解釋欣然接受外，行政院也在記者會中強調：整個停建決策的過程並沒有違憲 。

　　賴英照一開始就有提到：大法官說沒有違憲，外界不應該有所指摘；政院會在適當時機向立院詳細說明。行政院也強調：依據大法官會議的解釋，行政院在向立法院提出報告，以及朝野協商之前，核四應該處於停建狀態。至於內閣是否提出總辭，甚至建請總統解散國會，行政院都沒有正面答覆，只表示願意接受朝野協商，並且尊重任何協商的結果。

　　總統府方面，則是選在在行政院召開記者會後發佈三點書面聲明。表示總統府完全尊重大法官會議的釋憲結果，並對大法官辛勞及各界關心，表達最高的敬意和謝忱。其次，總統府認為核四案對於當前國家發展與後代子孫的未來有重大影響，釋憲結果已經為解決行政院與立法院部門的政策爭議，建立良好的模式與典範。相信兩院能本於民主憲政，堅守各自的崗位與職責，依據釋憲意旨，妥善處理有關核四的後續事宜。最後，在新世紀開始，國家發展有賴於政局的穩定。希望朝野能敞開胸懷、攜手合作，維護憲政的運作，增進人民的福祉，共同創作和諧安定的政治新局。