在獲知國華航空空難之後，行政院長蕭萬長立刻召集副院長和秘書長等相關人員召開緊急會議，蕭院長指示國防部和內政部盡全力搜救，交通部立刻成立空難處理中心。

　　對於又發生墜機意外，蕭院長相當震驚，在緊急會議之後，立刻指派交通部長蔡兆陽趕赴新竹瞭解空難情形，並且對空難做出搜救指示。

　　除了盡量搜救可能的生還者，給予旅客家屬提供服務之外，蕭院長還要求交通部儘速查明失事原因。