國民黨考紀會、傍晚針對這次修憲、反凍省黨籍國代，做出黨紀處份，包括林淵源在內的六名黨籍國代、都遭到停權處份，另外還有五名黨籍國代被處申誡。而被黨紀處分的林淵源則表示，坦然接受這個結果。

由於修憲後國民黨李主席指示對這次修憲過程中黨籍國代的表現要賞罰分明，因此考紀會下午召開會議，研商處理原則。這次國大工作會總共提報了十九位國代懲處名單，考紀會經過一個半小時的考慮，決定林淵源，陳治男，吳國重，龔興生等四位代表將處以停權一年半，而祥和會成員楊容明，林正國被停權一年，另外，還有林嫦如等五位代表被記申戒，考紀會強調這個結果是從輕處分。

面臨黨紀處分，國民黨大老林淵源透過電話說出了他的心情。

身為省府的政務委員，至今他還是不改反對凍省的立場，不過他不會退黨。