凍省通過之後，四大國際港將收歸中央，雖然地方還有不同意見，但交通部已著手規劃四大港的整體發展，其中國內吞吐量最大的高雄港，將被定位為洲際航線轉運中心。

交通部運研所下午向部長蔡兆陽提出台灣地區港埠整體發展計畫簡報，對於台灣四大港、各有定位，已被選定為海運轉運中心的高雄港，未來發展定位是洲際航線轉運中心，基隆港由於接近中正機場，可發展成為高價值港口，而積極爭取成為兩岸直航港口的台中港，是定位為物流後勤中心，花蓮港是雜貨進出港，交通部長蔡兆陽在聽完簡報後裁示，儘速邀集高雄市政府和港務局，協調深水碼頭建設計畫，由於高雄市至今仍反對港口收歸中央，因此蔡兆陽也表現了和地方協商的誠意。

由於現在的港埠是由省府管理，出現層層審核，影響服務品質的狀況，交通部還是傾向所有權歸中央，交由企業經營的模式比較可行。