一度引起華航與交通部關係緊張。不過，出現轉圜，華航基金會董事長汪敬煦表示，李總統要他直接和行政院長連戰商談董事長人選問題。華航對於交通部推薦董事人選，現在也改口說，可以商量。至於接任華航基金會董事長呼聲最高的人選是，行政院副院長徐立德。一個基金會的董事改選，竟然鬧得風波滿天，還驚動政府高層，倒是罕見。在交通部和華航基金會各有堅持的情況下，到底要不要納入政府監管的僵局，有了轉圜。在交通部長蔡兆陽晉見連戰之後，華航基金會董事長汪敬煦下午也表示，事情是可以商量的汪敬煦說，李總統曾經指示他，關於基金會董事長人選問題，應該和連戰談一談，汪敬煦已經決定，六月二十八號晉見院長，商談人事。對於外傳將由行政院副院長徐立德接任基金會董事長，汪敬煦說，他是個合適的人選，而徐立德本人則陷入長考中。

另一方面，交通部航政司下午也到基金會查帳，查了兩個鐘頭後的結論是，並沒有發現任何不法之處。