教育改革很多人關切，不過角度，立場不同，方法就不同。教育部長吳京所提出階段性廢止聯招的構想，就沒有獲得中研院院長李遠哲的認同。李院長希望吳部長多花時間閱讀教改報告，不要忙著到處剪綵。聽到不同的聲音，吳京到也坦然以對。

教育部長提出大學以申請方式入學的構想，中央研究院院長李遠哲贊不贊成？李遠哲院長希望教育部長在提出構想前，先好好研讀教改相關報告。對於中研院院長的質疑，吳京部長自認已經熟讀教改報告。

這樣的解釋是否意味李遠哲和吳京之間溝通不良？吳京笑著強調，李院哲院長是個很好的工作夥伴，他們之間絕對沒有不溝通的問題存在。