因為侵入我方領海作業，被屏東地檢署指揮扣押的日本籍第５８正丸號漁船，上午警方對十一名船員進行拍照存證後，隨即移送到地檢署交由檢察官複訊，由於這是我國第一次扣押闖入領海的外籍漁船，因此地檢署作業相當慎重，而根據相關法令與國際慣例，這艘日籍漁船和船員，大概會被處以罰金並且加以警告。

在昨天晚間被保七巡邏艇押回屏東東港的日本籍第５８正丸號漁船，上午依舊停靠在東港安檢站前，船上的九名日本籍船員與兩名印尼籍船員，則在檢查站內接受警員的登記與拍照存證，接著船員回到船上整理私人物品後，全部被帶到屏東地檢署，由承辦檢察官何克昌進行複訊，由於以往並沒有扣押外籍漁船的先例，因此檢方對本案相當慎重，而中日交流協會也派出代表前往關切，不過日方代表表示第５８正丸號的確侵入我方領海，因此日方將會尊重我國的法令，而到底檢察官會依違反國安法處理，還是依照漁業法加以罰款警告，目前還沒有定論：根據漁政單位表示，我國漁船也有被日方扣押的案例，而通常是在第一次處以警告罰款，第二次則沒收船隻魚貨，因此第５８正丸號應該也是會依照這種模式來處理，以免引起中日兩國間的漁業糾紛。