元旦另外一項重頭戲【晨跑活動】，清晨也在總統府前廣場，以及金門、馬祖、新竹四個地方同時開跑，估計全國共有五萬名民眾參與這項活動，為八十六年寫下健康活力的新開始。

這項由路跑協會主辦的愛我中華元旦路跑活動，清晨六點四十五分，在副總統兼行政院長連戰，以及政務委員馬英九等人的鳴槍下，正式開跑，隊伍從凱達格蘭大到出發後，沿著仁愛路林蔭大道，向國父紀念館前進，全長四點五公里，由於參與的民眾相當踴躍，因此出發之後，立刻在仁愛路形成一條長龍，非常壯觀，民眾有的慢跑，有的穿上直排輪刀溜冰鞋，甚至騎腳踏車或漫步，在元旦清晨，跑出健康的人生，主辦單位除了在終點舉行摸彩之外，還安排了兩廣醒獅團的表演，以及萬人有氧舞蹈，和參與晨跑的民眾一起同樂，今年的路跑活動，在路跑協會擴大舉辦下，在台北、金門、馬祖、新竹四地同時開跑，估計全國共有將近五萬名民眾，為民國八十六年，共同寫下了健康、活力的開始。