國發會在第三天的分組討論中，憲政和經濟兩個分組不約而同都針對黨營事業的性質進行辯論，朝野對於政黨可不可以經營投資事業，意見相當分歧。另外，在兩岸議題部分，各界對於是否要在國統會外另設立諮詢機構也沒有達成共識。